自1982年起，癌症即高居國人十大死因之首，於2016年癌症已占國人全部死因之27.7%。罹患癌症人數更是逐年攀升，不僅嚴重威脅國人健康，對家庭、社會、乃至國家影響甚鉅。癌症儼然已成為台灣當前所面臨之重要醫藥衛生課題。
「癌症研究所」是國家衛生研究院第一個成立、且為第一個升格改制 (2006年) 為研究所的研究單位。本所自設立以來，與國內重要臨床醫學中心建立合作關係，探究新穎、整體性之臨床試驗，並藉由實驗室執行轉譯醫學研究。
癌症研究所的使命是整合及協調基礎和臨床研究，以促進台灣流行癌症在預防、診斷和治療上創新策略的發展。癌研所透過平台進行整合研究，該平台包括實驗室的基礎學術研究、與成大醫院合作的早期臨床試驗及轉譯研究、以及在臺灣癌症臨床研究合作組織（TCOG）完整的全國性多中心臨床試驗架構下，執行國人好發癌症之大規模多中心臨床試驗研究。TCOG亦參與Paul Carbone Academia為台灣年輕醫療人員舉辦之臨床研究人員培訓計畫，並協助衛生主管機關執行醫院癌症診療品質認證和建立癌症核心測量指標，以促進台灣癌症病患照護之治療品質。
希冀經由此全方位與多面性之癌症研究規劃，加速突破目前癌症研究瓶頸，並提供國家重要癌症防治政策之實證研究基礎，為政府節省龐大醫療費用、推動我國生物經濟發展，最終達成『降低國人癌症的發生率及死亡率』之目標。
